More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0795 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  100 
 
 		 484 aa  946    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 443 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 468 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 467 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.01 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  31.06 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  31.11 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 461 aa  163  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 457 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 443 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 438 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  26.29 
 
 		 440 aa  114  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 536 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  24.95 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 441 aa  103  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 542 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  26.39 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 426 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 472 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 430 aa  98.2  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 530 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 440 aa  97.1  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 578 aa  96.7  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 454 aa  94  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 442 aa  93.2  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  24.61 
 
 		 424 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 457 aa  90.9  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 448 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 427 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 427 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  34.52 
 
 		 198 aa  90.5  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  23.63 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 416 aa  87  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 434 aa  87  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  25.27 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  24.45 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  25 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 413 aa  67  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>