More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4054 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  100 
 
 		 437 aa  879    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  95 
 
 		 432 aa  812    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 423 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.72 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  26.79 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3590  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3971  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0004  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.44219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  25.35 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 443 aa  94.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 423 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 430 aa  93.2  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 439 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 850 aa  89.4  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  27.44 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  25.99 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 449 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  23.52 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  22.94 
 
 		 448 aa  87.8  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  27.44 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  27.44 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  27.44 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  27.44 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  26.61 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  26.61 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  26.61 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  26.61 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  26.61 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  26.61 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  26.3 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 432 aa  86.3  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32014  predicted protein  22.47 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  26.3 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  26.81 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  23.42 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  27.16 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  23.42 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  27.16 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  26.25 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  26.25 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>