224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0004 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0004  major facilitator transporter  100 
 
 		 428 aa  838    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.44219  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 432 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44298  predicted protein  24.69 
 
 		 1736 aa  93.2  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 436 aa  90.5  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  23.83 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  24.19 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  23.95 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  23.91 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  23.91 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.51 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  23.96 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.21 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.71 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.03 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4615  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  23.8 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 520 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  23.8 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  21.56 
 
 		 467 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 453 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 435 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  33.86 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  32 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  27.88 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.27 
 
 		 525 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  29.65 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 441 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 398 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  30.5 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3633  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  29.8 
 
 		 526 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.14 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.54 
 
 		 536 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 626 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>