More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32014 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_32014  predicted protein  100 
 
 
467 aa  939    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  38.83 
 
 
488 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  37.8 
 
 
444 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  37.8 
 
 
444 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  31.38 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  31.15 
 
 
421 aa  211  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
423 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  28.18 
 
 
436 aa  179  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44298  predicted protein  30.28 
 
 
1736 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  23.72 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  22.57 
 
 
437 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  26.13 
 
 
453 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  23.69 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  21.34 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  31.08 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  27.65 
 
 
432 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  30.82 
 
 
418 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.21 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  27.06 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.06 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.21 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.21 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.21 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.06 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.21 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  27.65 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  31.39 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  23.99 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  25.3 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  24.23 
 
 
465 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  32.79 
 
 
501 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  23.52 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  30.67 
 
 
441 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  23.28 
 
 
467 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  23.72 
 
 
440 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  27.27 
 
 
438 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 
478 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  23.28 
 
 
467 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.53 
 
 
432 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
432 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  28.21 
 
 
432 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  23.76 
 
 
470 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.08 
 
 
442 aa  60.1  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.99 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  21.66 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  24.55 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  27.81 
 
 
420 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  25.65 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  27.78 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  26.97 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 
503 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  23.37 
 
 
433 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 
426 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
452 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
426 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  27.54 
 
 
438 aa  56.6  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
529 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  23.98 
 
 
451 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 
532 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 
500 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  27.57 
 
 
542 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
427 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  22.06 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.7 
 
 
506 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
451 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  32.08 
 
 
452 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  26.88 
 
 
438 aa  55.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2184  major facilitator transporter  27.88 
 
 
398 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  32.08 
 
 
452 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  33.96 
 
 
452 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  29.19 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3588  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  26.04 
 
 
395 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226455  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.86 
 
 
438 aa  54.3  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  21.99 
 
 
428 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  28.5 
 
 
438 aa  53.9  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
483 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  26.67 
 
 
440 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  27.38 
 
 
458 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.44 
 
 
459 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  26.67 
 
 
440 aa  53.5  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 
531 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  27.22 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43382  predicted protein  29.7 
 
 
555 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0004  major facilitator transporter  21.58 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.44219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3590  major facilitator transporter  30.25 
 
 
474 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293443  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  25.15 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  31.13 
 
 
452 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  31.13 
 
 
452 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  22.65 
 
 
449 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 
532 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  33.33 
 
 
475 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  31.13 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.05 
 
 
442 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  26.67 
 
 
440 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  31.13 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  29.35 
 
 
455 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  26.67 
 
 
440 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 
501 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  23.08 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>