More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5089 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  89.12 
 
 		 432 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  88.89 
 
 		 432 aa  766    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  856    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  66.97 
 
 		 434 aa  548  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  62.27 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  62.27 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  62.05 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  62.05 
 
 		 440 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  61.76 
 
 		 442 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.41 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 406 aa  236  7e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 468 aa  186  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 474 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.92 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 439 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 439 aa  156  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 445 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 415 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 408 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  32.32 
 
 		 418 aa  127  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.14 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  29.75 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  27.23 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 432 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.53 
 
 		 433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  27.53 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.53 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.31 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  28.47 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  30.44 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  31.03 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  29.76 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  31.03 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  31.03 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  31.03 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  31.09 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  28.57 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  28.79 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 421 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 428 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  28.79 
 
 		 426 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  28.79 
 
 		 426 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  24.75 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  24.75 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  24.75 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  28.37 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  28.37 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>