More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1684 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  100 
 
 
434 aa  850    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  66.97 
 
 
435 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  67.85 
 
 
432 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  68.09 
 
 
432 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  63.17 
 
 
442 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  61.29 
 
 
440 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  61.15 
 
 
440 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  61.15 
 
 
440 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  60.83 
 
 
440 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 
406 aa  253  5.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 
427 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.68 
 
 
427 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 
468 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.6 
 
 
422 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  30.37 
 
 
467 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 
474 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  32.52 
 
 
432 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  32.29 
 
 
432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  32.18 
 
 
432 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  33.18 
 
 
434 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  32.48 
 
 
432 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  29.43 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  29.43 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  32.56 
 
 
434 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
451 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  31.76 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  27.91 
 
 
449 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  30 
 
 
474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  30.5 
 
 
435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
445 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  29.67 
 
 
428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  30.75 
 
 
496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  30.26 
 
 
496 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  30.26 
 
 
496 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  30.26 
 
 
496 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  30.26 
 
 
496 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  29.77 
 
 
474 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  29.55 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  29.39 
 
 
496 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  28.73 
 
 
457 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  29.39 
 
 
496 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  29.39 
 
 
496 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  29.39 
 
 
496 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  29.32 
 
 
474 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  29.39 
 
 
496 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  29.32 
 
 
474 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  28.73 
 
 
457 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  29.39 
 
 
496 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  28.9 
 
 
430 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  29.39 
 
 
496 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  29.11 
 
 
496 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  29.11 
 
 
496 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 
430 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  28.64 
 
 
428 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  28.64 
 
 
428 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  27.83 
 
 
420 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  27.83 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  27.83 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  30.41 
 
 
421 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  29.61 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  27.38 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  28 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  28.14 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  28.23 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  29.26 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  29.72 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  28.14 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  27.87 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  28.81 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  29.22 
 
 
428 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  28.38 
 
 
445 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  27.99 
 
 
409 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  26.49 
 
 
432 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
433 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  29.32 
 
 
412 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  28.81 
 
 
423 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  28.15 
 
 
445 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1885  major facilitator transporter  29.95 
 
 
450 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  26.87 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  26.49 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  29.57 
 
 
410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  26.49 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  29.62 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  30.95 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.99 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.11 
 
 
432 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  28.61 
 
 
415 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  28.87 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>