More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2777 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  91.57 
 
 		 451 aa  794    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  85.14 
 
 		 449 aa  730    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  91.57 
 
 		 451 aa  794    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 451 aa  886    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  60.36 
 
 		 445 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  60.36 
 
 		 445 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  51.96 
 
 		 467 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  36.91 
 
 		 422 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 406 aa  192  8e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1413  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 532 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 434 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 445 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 445 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 428 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  31.51 
 
 		 429 aa  156  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  29.02 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 428 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 423 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  31.24 
 
 		 440 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  31.24 
 
 		 440 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  31 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  28.64 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  30.07 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  30.22 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 398 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 398 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 398 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  28.38 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  29.08 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  29.91 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.28 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  28.97 
 
 		 429 aa  146  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.65 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.42 
 
 		 433 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 428 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.57 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.57 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 434 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4878  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4700  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  27.51 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5470  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 426 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5392  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 426 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 423 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  28.09 
 
 		 474 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  28.54 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  30.16 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6033  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486241  normal  0.0413157 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  27.87 
 
 		 474 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  27.77 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 436 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>