More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1413 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1413  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 532 aa  1043    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 451 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 468 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.9 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 427 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.81 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.52 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6033  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486241  normal  0.0413157 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4700  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 426 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 415 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 402 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 412 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 410 aa  98.2  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 412 aa  97.4  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1885  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 450 aa  97.1  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  31.73 
 
 		 428 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 410 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  33.47 
 
 		 410 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 446 aa  94.4  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 415 aa  94.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5470  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 426 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5392  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 426 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4878  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 426 aa  94  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  23.96 
 
 		 510 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  23.96 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  23.96 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  24.13 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  31.67 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 433 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 406 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  24.13 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  24.13 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  24.13 
 
 		 496 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  24.34 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  24.13 
 
 		 496 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  24.13 
 
 		 496 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 406 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  31.42 
 
 		 408 aa  91.3  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 432 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 432 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  25.54 
 
 		 459 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 432 aa  90.5  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 416 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  31.82 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  31.82 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  30.2 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  31.82 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  31.82 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  31.82 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  31.82 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  31.82 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  23.93 
 
 		 496 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  23.93 
 
 		 496 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  23.93 
 
 		 496 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 416 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 428 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  25.68 
 
 		 495 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  23.93 
 
 		 496 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  23.93 
 
 		 496 aa  89.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  23.93 
 
 		 496 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 406 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 406 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 406 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 429 aa  88.6  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  35.76 
 
 		 411 aa  87.8  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 423 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 436 aa  87.4  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  26.1 
 
 		 451 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  31.5 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  23.72 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>