More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6215 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 427 aa  837    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  95.32 
 
 		 427 aa  802    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.1 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.2 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 440 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 406 aa  242  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 467 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 474 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 437 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 435 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 436 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 409 aa  146  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  31.57 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  30.42 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  30.47 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  31.79 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 416 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  29 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  28.54 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.59 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.41 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.92 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  28.92 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.92 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.92 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  28.92 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.92 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  28.67 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.28 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.34 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  27.65 
 
 		 496 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  28.11 
 
 		 496 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 412 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  28.11 
 
 		 496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  27.99 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>