More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6033 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4700  major facilitator transporter  86.15 
 
 		 426 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6033  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  832    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486241  normal  0.0413157 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4878  major facilitator transporter  85.68 
 
 		 426 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5392  major facilitator transporter  85.21 
 
 		 426 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5470  major facilitator transporter  85.21 
 
 		 426 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  32.34 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 432 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.79 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  29.72 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.51 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  30.66 
 
 		 445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 437 aa  153  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  30.66 
 
 		 445 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  30.79 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  30.18 
 
 		 428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  30.84 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 491 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.84 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  27.84 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  27.84 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 411 aa  147  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 432 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  30.64 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 409 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 433 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 428 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  28.51 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 409 aa  143  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 451 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  28.74 
 
 		 429 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  29.72 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 451 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  31.11 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 424 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 451 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 451 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 424 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 425 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.07 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  30 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  28 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.76 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.76 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.76 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>