More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5703 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  91.57 
 
 
451 aa  795    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  85.59 
 
 
449 aa  738    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  100 
 
 
451 aa  886    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  99.78 
 
 
451 aa  885    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  59.5 
 
 
445 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  59.5 
 
 
445 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  51.5 
 
 
467 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  36.14 
 
 
422 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
468 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
474 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
406 aa  193  6e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  31.51 
 
 
435 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  30.68 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1413  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 
532 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  30.68 
 
 
434 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  30.75 
 
 
432 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  30.45 
 
 
432 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  30.52 
 
 
432 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  30.52 
 
 
432 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  32.75 
 
 
440 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  32.75 
 
 
440 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  33.03 
 
 
435 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  30.98 
 
 
429 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  32.36 
 
 
440 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  29.45 
 
 
428 aa  156  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  30.18 
 
 
445 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  30.23 
 
 
428 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  30.18 
 
 
445 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  32.13 
 
 
440 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
427 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.82 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  30.59 
 
 
411 aa  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  30.2 
 
 
429 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  30.37 
 
 
423 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  29.06 
 
 
428 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  30.38 
 
 
434 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  27.17 
 
 
428 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.5 
 
 
432 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  27.87 
 
 
428 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
432 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  30.5 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  29.6 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  30.23 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
439 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
439 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.05 
 
 
432 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  28.92 
 
 
423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  27.99 
 
 
428 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  29.45 
 
 
429 aa  147  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  31.15 
 
 
398 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  31.15 
 
 
398 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  31.15 
 
 
398 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  30.37 
 
 
423 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.99 
 
 
425 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.16 
 
 
442 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  29.32 
 
 
409 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.69 
 
 
402 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  29.41 
 
 
424 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.8 
 
 
433 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  27.93 
 
 
409 aa  142  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  30.65 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  27.66 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  30.09 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  29.41 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.05 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.28 
 
 
432 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  29.22 
 
 
434 aa  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  28.16 
 
 
425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  27.93 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1885  major facilitator transporter  29.85 
 
 
450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.25 
 
 
432 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.25 
 
 
433 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  27.85 
 
 
425 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  28.28 
 
 
428 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
433 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.05 
 
 
432 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.05 
 
 
432 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  28.8 
 
 
428 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
423 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.03 
 
 
433 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  27.87 
 
 
474 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4878  major facilitator transporter  30.95 
 
 
426 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  28.64 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  28.31 
 
 
420 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  28.31 
 
 
420 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  26.79 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  28.08 
 
 
420 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  28.08 
 
 
420 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  27.31 
 
 
416 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5470  major facilitator transporter  30.48 
 
 
426 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5392  major facilitator transporter  30.48 
 
 
426 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  29.55 
 
 
415 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  27.64 
 
 
474 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  30.73 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4700  major facilitator transporter  29.48 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164238  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>