More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1553 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  868    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  868    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  31.7 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  31.28 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  32.36 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  32 
 
 		 411 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 432 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 429 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 430 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  31.24 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  31.3 
 
 		 429 aa  160  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 423 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.62 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 436 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 425 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.38 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  29.58 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  29.18 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  29.18 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  29.18 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.27 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.05 
 
 		 433 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.05 
 
 		 432 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.05 
 
 		 433 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 432 aa  143  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 432 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  29.1 
 
 		 432 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  30.02 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 423 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  29.56 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.18 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  28.98 
 
 		 416 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 398 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 398 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 398 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  28 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  29.68 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 440 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 440 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 440 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  29.11 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  29.11 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  29.11 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  29.11 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  28.87 
 
 		 474 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>