More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2998 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  82.58 
 
 		 440 aa  715    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  81.67 
 
 		 440 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 		 442 aa  857    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  82.81 
 
 		 440 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  82.81 
 
 		 440 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  64.72 
 
 		 432 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  63.79 
 
 		 432 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  61.76 
 
 		 435 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  63.17 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.94 
 
 		 427 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 468 aa  182  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.87 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 474 aa  139  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  33.48 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  33.71 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 433 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  31.99 
 
 		 435 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 451 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 451 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  28.87 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  33.26 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  33.03 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  33.26 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 432 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  32.88 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  32.88 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.86 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.09 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 445 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  29.64 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 428 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  30 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  31 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.79 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.79 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.79 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  29.79 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  29.24 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.79 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 415 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 421 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.79 
 
 		 408 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 436 aa  113  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  29.52 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  29.74 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1885  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  30.79 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>