More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0457 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  99.09 
 
 		 440 aa  855    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  97.95 
 
 		 440 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  82.81 
 
 		 442 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  862    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  862    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  62.27 
 
 		 435 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  63.85 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  63.85 
 
 		 432 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  61.15 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 427 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.2 
 
 		 427 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.04 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 451 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  29.63 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 445 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  29.9 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.14 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  29.63 
 
 		 432 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  29.63 
 
 		 433 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  29.63 
 
 		 433 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  27.34 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 439 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 425 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 439 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 428 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  28.87 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  31.31 
 
 		 474 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  30.49 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 491 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  28.07 
 
 		 428 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  31.93 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  30.86 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  30.41 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  25.43 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  25.43 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  25.43 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  29.9 
 
 		 432 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 409 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.36 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 406 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 406 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 406 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.5 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  28.97 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.5 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.5 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.5 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  29.5 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  29.51 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  28.97 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>