More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0319 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 474 aa  959    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1885  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 406 aa  230  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 		 468 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 467 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 451 aa  183  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 445 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.11 
 
 		 432 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1413  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144636  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.62 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.48 
 
 		 422 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.73 
 
 		 442 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 440 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 440 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 440 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  27 
 
 		 440 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 451 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 430 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  29.01 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.44 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 411 aa  120  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 433 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  27.91 
 
 		 423 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 420 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 420 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 420 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 427 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.44 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.67 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 420 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  26.84 
 
 		 429 aa  113  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 402 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 437 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 408 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.25 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.25 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 406 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.25 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.25 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  27.25 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  27.25 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 420 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 435 aa  103  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  24.88 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 416 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  37.76 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>