More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1447 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  99.78 
 
 		 445 aa  879    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 445 aa  881    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  60.36 
 
 		 451 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  59.5 
 
 		 451 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  59.5 
 
 		 451 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  60.32 
 
 		 449 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  51.52 
 
 		 467 aa  435  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  37.39 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 468 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  31.65 
 
 		 445 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  31.65 
 
 		 445 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  31.65 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  32.19 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  31 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 434 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 432 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 434 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  32.33 
 
 		 398 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  32.33 
 
 		 398 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  32.33 
 
 		 398 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 430 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  31.91 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.49 
 
 		 432 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 425 aa  156  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 428 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 419 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  29.64 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 428 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 419 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 428 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.51 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  30 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  30 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  29.02 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.98 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 423 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  30.07 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 		 429 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  30.24 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 432 aa  146  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  30.07 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.07 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.05 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.41 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  30.07 
 
 		 457 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  30.07 
 
 		 474 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  30.07 
 
 		 474 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  30.07 
 
 		 457 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  29.84 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  29.98 
 
 		 474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 434 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 410 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 410 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>