More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4823 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  88.89 
 
 		 435 aa  766    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  98.61 
 
 		 432 aa  843    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  850    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  63.79 
 
 		 442 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  63.85 
 
 		 440 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  63.85 
 
 		 440 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  63.85 
 
 		 440 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  67.85 
 
 		 434 aa  538  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  63.38 
 
 		 440 aa  537  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.59 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 467 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.02 
 
 		 422 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 491 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 432 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  25.87 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 435 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  34.15 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1413  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  29.91 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.72 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 434 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  29.4 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  29.17 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 415 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 429 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  31.17 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  31.17 
 
 		 496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  31.17 
 
 		 496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  31.17 
 
 		 496 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  31.22 
 
 		 496 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  29.23 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  27.7 
 
 		 429 aa  114  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 404 aa  113  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  30.86 
 
 		 496 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  30.86 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  30.86 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  30.86 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  30.86 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  30.86 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  30.86 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  30.45 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  30.45 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.13 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>