More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1885 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1885  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  881    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0319  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 474 aa  266  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.230741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1460  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1611  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1921  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 451 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5703  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0181429  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1684  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 434 aa  136  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.266569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4898  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 468 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2998  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.02 
 
 		 442 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0457  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0936  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0898  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.885104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2777  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976479  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4038  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1383  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  normal  0.495047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1842  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.72 
 
 		 432 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1447  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110143  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5089  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177988  normal  0.026694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.06 
 
 		 422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2702  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 445 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.62 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  31.35 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1413  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 532 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  26.29 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 430 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  24.87 
 
 		 421 aa  99  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 409 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  27.67 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  29 
 
 		 474 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  27.67 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  27.34 
 
 		 418 aa  97.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 409 aa  97.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  27.1 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 474 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  28.35 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 432 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6033  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486241  normal  0.0413157 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 432 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 420 aa  93.2  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  24.43 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  25.84 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  25.84 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  25.84 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  28.35 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  28.35 
 
 		 474 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  28.35 
 
 		 474 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  27.4 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  28.35 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 432 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 424 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  25.95 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 423 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 433 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 410 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 425 aa  90.1  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  23.08 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  23.08 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>