128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44298 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44298  predicted protein  100 
 
 		 1736 aa  3612    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  32.39 
 
 		 488 aa  205  8e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 423 aa  196  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 421 aa  177  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 422 aa  177  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  29.91 
 
 		 444 aa  163  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  29.91 
 
 		 444 aa  163  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32014  predicted protein  30.08 
 
 		 467 aa  145  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 443 aa  141  8.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 436 aa  137  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06060  eukaryotic translation initiation factor subunit eIF-4F, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09490)  29.9 
 
 		 1518 aa  122  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.857112 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47943  predicted protein  24.23 
 
 		 1167 aa  112  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03900  eukaryotic initiation factor 4F subunit P130, putative  26.33 
 
 		 1494 aa  103  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_17868  Eukaryotic initiation factor 4F subunit p150 (eIF4F p150) (eIF-4F p150) (mRNA cap-binding protein complex subunit p150)  25.23 
 
 		 365 aa  100  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.0000259542  normal  0.93221 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03740  eukaryotic initiation factor 4F subunit P130, putative  24.38 
 
 		 1203 aa  94.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0004  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 428 aa  91.3  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.44219  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7162  predicted protein  27.08 
 
 		 269 aa  91.3  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0595164  normal  0.389571 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 426 aa  80.9  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 405 aa  65.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 433 aa  63.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 444 aa  61.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 438 aa  62  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  24.23 
 
 		 438 aa  60.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  24.92 
 
 		 410 aa  61.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 464 aa  60.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  25.35 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  25.07 
 
 		 526 aa  57.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 396 aa  58.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 387 aa  57  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  21.22 
 
 		 425 aa  57  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 389 aa  55.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  23.58 
 
 		 370 aa  55.5  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 436 aa  55.5  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 437 aa  55.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  24.79 
 
 		 403 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  24.79 
 
 		 403 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  24.79 
 
 		 403 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 407 aa  53.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  24.79 
 
 		 403 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  24.79 
 
 		 403 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  24.79 
 
 		 403 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 438 aa  53.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  24.79 
 
 		 403 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  24.79 
 
 		 403 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 443 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 399 aa  53.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 456 aa  53.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 438 aa  53.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 429 aa  52.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 464 aa  53.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 429 aa  52.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 429 aa  52.4  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  21.62 
 
 		 435 aa  52  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  21.96 
 
 		 445 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 458 aa  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 458 aa  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 398 aa  52  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 429 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 436 aa  51.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 430 aa  50.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  23.19 
 
 		 507 aa  50.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4872  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.62 
 
 		 404 aa  50.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 395 aa  50.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 436 aa  50.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  21.36 
 
 		 438 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  22.91 
 
 		 387 aa  50.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 447 aa  50.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  27.16 
 
 		 407 aa  50.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 438 aa  50.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 400 aa  50.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 411 aa  50.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 461 aa  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 424 aa  49.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 404 aa  49.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 468 aa  49.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 419 aa  49.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  21.33 
 
 		 437 aa  49.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.61 
 
 		 401 aa  49.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 417 aa  49.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 440 aa  49.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.61 
 
 		 401 aa  49.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 441 aa  49.3  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 429 aa  49.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  30.32 
 
 		 483 aa  49.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 443 aa  49.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 490 aa  48.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 435 aa  48.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 406 aa  48.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_25795  predicted protein  22.67 
 
 		 689 aa  48.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  23.74 
 
 		 431 aa  48.9  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  22.01 
 
 		 433 aa  48.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 467 aa  48.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 398 aa  47.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  21.17 
 
 		 466 aa  48.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 405 aa  47.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 457 aa  47.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>