More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1860 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
407 aa  790    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  47.98 
 
 
400 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  46.1 
 
 
406 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  47.8 
 
 
474 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  46.22 
 
 
439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  46.63 
 
 
404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  35.68 
 
 
409 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  35.68 
 
 
432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  35.68 
 
 
432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  35.95 
 
 
432 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  35.68 
 
 
432 aa  239  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  35.68 
 
 
409 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  35.95 
 
 
409 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1602  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 
397 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.822516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
399 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1730  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 
415 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2610  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
407 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  26.77 
 
 
384 aa  123  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1846  transporter protein  32.14 
 
 
229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.958956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
391 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  26.61 
 
 
405 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.95 
 
 
386 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
385 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 
383 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1847  transporter protein  35.37 
 
 
188 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
420 aa  89.7  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  22.28 
 
 
388 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  26.03 
 
 
390 aa  87  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  29 
 
 
387 aa  87  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 
590 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  30 
 
 
565 aa  86.7  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.67 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  31.67 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  22.88 
 
 
477 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  33.79 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  28.89 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  28.89 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.05 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  22.9 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.42 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  28.42 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.64 
 
 
480 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.89 
 
 
478 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.89 
 
 
479 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.89 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.89 
 
 
479 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.89 
 
 
478 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
396 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  25.67 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  23.55 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  23.55 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  24.92 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 
495 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  23.55 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  23.55 
 
 
453 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  23.55 
 
 
453 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  23.55 
 
 
453 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  23.55 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
449 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2676  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.89 
 
 
407 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.95 
 
 
657 aa  77  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  25.42 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.26 
 
 
537 aa  76.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  24.81 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.66 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.93 
 
 
469 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  25.99 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  34.25 
 
 
481 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.38 
 
 
522 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  28.8 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  30.91 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  24.15 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5055  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.05 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
511 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  25.86 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
491 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  23.92 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  25.57 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  27.74 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
491 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 
529 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 
529 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  28.8 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.32 
 
 
539 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>