More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1785 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  100 
 
 		 422 aa  837    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  97.61 
 
 		 421 aa  812    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  58.63 
 
 		 436 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 423 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  36.17 
 
 		 488 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  31.29 
 
 		 444 aa  222  9e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  31.29 
 
 		 444 aa  222  9e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32014  predicted protein  31.38 
 
 		 467 aa  199  7.999999999999999e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44298  predicted protein  29.22 
 
 		 1736 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 418 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 466 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3590  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3971  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  33.88 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  33.33 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.94 
 
 		 476 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.8 
 
 		 475 aa  94.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 449 aa  93.6  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  33.53 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  29.96 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0004  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.44219  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 468 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.5 
 
 		 472 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 438 aa  89.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 542 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  25.34 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 473 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 465 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 474 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 467 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 474 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 465 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 452 aa  86.3  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 467 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.8 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.8 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  22.83 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  24.74 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  23.37 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>