More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2478 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  69.64 
 
 		 409 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  70.07 
 
 		 408 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  67.01 
 
 		 408 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  65.8 
 
 		 403 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  65.8 
 
 		 398 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  66.5 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 417 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  29.94 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  29.8 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 525 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23780  arabinose efflux permease family protein  29.05 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  22.65 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  21.94 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  32.48 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3708  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  25.39 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  32.52 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  22.51 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  31.33 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  24.58 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0890  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  24.58 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 431 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  28.89 
 
 		 502 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 		 530 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  26.94 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.84 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.97 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10152  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04900)  24.06 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5394  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326407  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29400  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  26.22 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  21.52 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  30 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  27.78 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.32 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  22.34 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  27.06 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  28.49 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.75 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  33.91 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  20.57 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.33 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  31.49 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  28.09 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>