More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5891 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  754    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  89.46 
 
 		 393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  73.44 
 
 		 428 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 398 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 408 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  39.68 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 408 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 417 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 399 aa  189  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  36.34 
 
 		 416 aa  159  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  31.96 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  32 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  29.11 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.18 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  25.61 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  28.26 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  24.48 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.35 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1322  major facilitator superfamily transporter  32.83 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  23.72 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  25.32 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  25.32 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.52 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1692  Xaa-His dipeptidase  23.77 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 520 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  31.94 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  29 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1622  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1095  MFS transporter  24.47 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3946  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501958  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2259  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.47 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.41183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.53 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0556  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  24.47 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0941  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  24.47 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 590 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2136  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  24.47 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0945  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  24.47 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402156  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4409  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  32.73 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  29.95 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.42 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  32.73 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  32.73 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  32.73 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  29.84 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0749  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.78 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1697  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  33.65 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>