More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05543 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  764    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  84.9 
 
 
406 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  84.9 
 
 
406 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  46.48 
 
 
403 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  42.6 
 
 
403 aa  252  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  47.12 
 
 
410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1580  major facilitator superfamily MFS_1  50.44 
 
 
425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  46.74 
 
 
412 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  46.74 
 
 
412 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  46.74 
 
 
412 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.78 
 
 
405 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  42.13 
 
 
415 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 
399 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  45.58 
 
 
405 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  44.68 
 
 
399 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  48.36 
 
 
420 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.21 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  42.09 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4753  major facilitator superfamily MFS_1  50.44 
 
 
407 aa  219  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
415 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  43.88 
 
 
403 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  45.18 
 
 
411 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.209632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  44.63 
 
 
410 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  45.18 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  41.11 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  43.15 
 
 
429 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  44.27 
 
 
398 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  44 
 
 
398 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  44 
 
 
398 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  44 
 
 
398 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  42.89 
 
 
429 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  44 
 
 
398 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  38.75 
 
 
403 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.34 
 
 
394 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  36.6 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  36.34 
 
 
399 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  36.57 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  43.62 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  36.39 
 
 
385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  43.94 
 
 
399 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  35.79 
 
 
383 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  43.4 
 
 
399 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  43.4 
 
 
399 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  42.98 
 
 
394 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  43.88 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  36.08 
 
 
399 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
391 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  43.62 
 
 
399 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
394 aa  193  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  40.63 
 
 
391 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
396 aa  193  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.11 
 
 
403 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  35.98 
 
 
398 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  43.26 
 
 
394 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  39.73 
 
 
389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  43.5 
 
 
398 aa  189  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 
403 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2534  major facilitator superfamily transporter  46.17 
 
 
417 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  35.7 
 
 
398 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 
396 aa  186  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  35.58 
 
 
389 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  35.58 
 
 
389 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  36.54 
 
 
411 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  39.18 
 
 
402 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 
408 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 
402 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  39.53 
 
 
400 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  35.71 
 
 
390 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 
402 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  39.04 
 
 
421 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  36.27 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  36.27 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  36.27 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  35.7 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  36.16 
 
 
405 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
389 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
389 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  36.14 
 
 
405 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  35.73 
 
 
400 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  36.34 
 
 
407 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  37.46 
 
 
387 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  35.71 
 
 
426 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  36.01 
 
 
400 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  36.01 
 
 
400 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  39.21 
 
 
401 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  36.91 
 
 
404 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  32.02 
 
 
393 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  32.88 
 
 
415 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  35.12 
 
 
395 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  36.15 
 
 
404 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  33.33 
 
 
399 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 
418 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  34.88 
 
 
394 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  33.06 
 
 
399 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  33.06 
 
 
399 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>