More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4422 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  786    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  27.7 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  25.25 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  26.05 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  27.45 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  26.07 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 504 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  29.39 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.98 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  24.93 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  28.19 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.32 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  27.72 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  24.81 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.32 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.36 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  26.04 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.49 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.66 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07167  conserved hypothetical protein  24.92 
 
 		 521 aa  73.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.63 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.57 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.63 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.43 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.58 
 
 		 627 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.74 
 
 		 609 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 		 538 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.34 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  26.82 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.14 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  30.6 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  26.26 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  26.26 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.14 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 480 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  30.71 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  23.53 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29400  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  26.42 
 
 		 549 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.98 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>