More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0995 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  100 
 
 		 416 aa  788    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 406 aa  299  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  42.67 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 408 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 428 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  31.47 
 
 		 402 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 402 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  27.39 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4220  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 510 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  23.14 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  22.35 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  22.74 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  22.92 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  31.46 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  23.34 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.47 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  30.77 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.31 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  23.95 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 520 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.27 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  23.95 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  32.53 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  23.95 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 		 529 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  23.68 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  27.64 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.9 
 
 		 514 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.19 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.49 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  31.29 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  30.91 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  26.6 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01157  multidrug resistance membrane translocase  31.58 
 
 		 501 aa  69.7  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.11 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 512 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.18 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.14 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  33.68 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2214  multidrug resistance protein, putative  25.07 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.82 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.34 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.54 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.31 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.09 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  21.23 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.93 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.38 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.79 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.05 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 		 509 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.81 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 518 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  21.83 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.11 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.11 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 505 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1544  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.63 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.11 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>