More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1390 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  100 
 
 
400 aa  793    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  65.21 
 
 
393 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  55.19 
 
 
400 aa  411  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  37.47 
 
 
405 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  38.1 
 
 
409 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  37.72 
 
 
409 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 
424 aa  245  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  38.86 
 
 
399 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  37.47 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  37.34 
 
 
417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  37.34 
 
 
417 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 
417 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  37.34 
 
 
417 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  37.34 
 
 
417 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  37.34 
 
 
417 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  37.34 
 
 
417 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  35.6 
 
 
421 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  37.22 
 
 
405 aa  239  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  35.9 
 
 
434 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 
407 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 
410 aa  236  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  37.17 
 
 
411 aa  235  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  36.69 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  37.06 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2913  major facilitator transporter  36.04 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  36.83 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 
410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  36.93 
 
 
414 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  40.22 
 
 
416 aa  233  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  37.06 
 
 
438 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  36.36 
 
 
425 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  37.2 
 
 
414 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
422 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
422 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 
404 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  37.33 
 
 
418 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  36.12 
 
 
414 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
404 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  35.97 
 
 
424 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  37.53 
 
 
417 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  37.53 
 
 
417 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  37.53 
 
 
417 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  36.83 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  37.27 
 
 
417 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2214  multidrug resistance protein, putative  39.78 
 
 
409 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  37.27 
 
 
417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 
407 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  37.06 
 
 
422 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2832  major facilitator transporter  34.58 
 
 
415 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2957  major facilitator transporter  34.58 
 
 
415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2814  major facilitator transporter  34.69 
 
 
415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.807872  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1917  multidrug resistance protein, putative  34.9 
 
 
413 aa  215  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  33.01 
 
 
437 aa  215  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1622  major facilitator transporter  33.67 
 
 
436 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1544  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1697  major facilitator transporter  33.58 
 
 
436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  35.89 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  35.47 
 
 
402 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 
434 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1692  Xaa-His dipeptidase  34.86 
 
 
436 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  34.88 
 
 
434 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  34.88 
 
 
417 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1731  major facilitator transporter  36.04 
 
 
422 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  37.37 
 
 
409 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  34.11 
 
 
406 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02138  hypothetical protein  37.63 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  33.61 
 
 
526 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
412 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  34.15 
 
 
481 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  34.15 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  34.15 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  34.15 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  34.15 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  34.15 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  35.89 
 
 
433 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  34.15 
 
 
537 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  34.89 
 
 
413 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  34.03 
 
 
441 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  34.03 
 
 
441 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  36.04 
 
 
432 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  35.44 
 
 
445 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  36.04 
 
 
422 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
405 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  30.05 
 
 
426 aa  192  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
438 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003683  permease  36.93 
 
 
407 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
438 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  33.98 
 
 
387 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
402 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4186  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
408 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513939  normal  0.0375994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
387 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45180  Major facilitator family transporter  37.28 
 
 
457 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 
438 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  32.17 
 
 
384 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 
440 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.899358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>