More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0208 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  100 
 
 
429 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  100 
 
 
429 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  100 
 
 
481 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  99.3 
 
 
537 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  93.66 
 
 
526 aa  673    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  100 
 
 
428 aa  813    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  100 
 
 
429 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  100 
 
 
429 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  75.43 
 
 
406 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  75.83 
 
 
431 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0084  major facilitator transporter  76.32 
 
 
423 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  57.11 
 
 
428 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  57.29 
 
 
429 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  52.87 
 
 
412 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  57.54 
 
 
448 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  48.95 
 
 
421 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  52.54 
 
 
499 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  54.16 
 
 
426 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  51.29 
 
 
417 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  53 
 
 
441 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  53 
 
 
441 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  51.06 
 
 
434 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  52.75 
 
 
413 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  49.26 
 
 
438 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  48.73 
 
 
418 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 
422 aa  346  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
404 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  50.13 
 
 
404 aa  346  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  49.63 
 
 
438 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  49.07 
 
 
424 aa  345  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
407 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479452 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  44.42 
 
 
417 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
417 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  44.42 
 
 
417 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  44.42 
 
 
417 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  48.94 
 
 
414 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  44.42 
 
 
417 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  44.42 
 
 
417 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  44.42 
 
 
417 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  44.42 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  51.06 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  48.05 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  54.67 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  47.41 
 
 
422 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  48.4 
 
 
414 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  54.1 
 
 
402 aa  335  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 
424 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  53.47 
 
 
445 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2302  major facilitator transporter  49.88 
 
 
448 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.44154  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  47.77 
 
 
414 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  52.79 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  46.57 
 
 
422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 
407 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 
438 aa  325  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  46.06 
 
 
438 aa  325  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  45.96 
 
 
417 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  48.77 
 
 
434 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  45.97 
 
 
417 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  45.72 
 
 
417 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  46.08 
 
 
417 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  46.08 
 
 
417 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  46.08 
 
 
417 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  45.84 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 
393 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 
425 aa  309  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  48.63 
 
 
416 aa  307  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  51.17 
 
 
409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  44.77 
 
 
410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  52.67 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  46.35 
 
 
432 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  46.35 
 
 
422 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0657  major facilitator transporter  52.67 
 
 
399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 
405 aa  279  8e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45180  Major facilitator family transporter  49.74 
 
 
457 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  48.97 
 
 
438 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4723  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 
413 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0900603  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2970  major facilitator superfamily MFS_1  45.65 
 
 
408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 
422 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4186  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 
408 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513939  normal  0.0375994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2978  major facilitator transporter  50.27 
 
 
390 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
428 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  42.05 
 
 
419 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  36.99 
 
 
400 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  39.78 
 
 
405 aa  210  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2213  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 
428 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175074  decreased coverage  0.00000120086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22270  arabinose efflux permease family protein  41.71 
 
 
410 aa  209  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00681057  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  34.29 
 
 
400 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 
434 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03550  arabinose efflux permease family protein  40.93 
 
 
376 aa  204  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
397 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  31.82 
 
 
410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  31.82 
 
 
410 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  31.82 
 
 
445 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  34.27 
 
 
393 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  31.55 
 
 
410 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  33.25 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1490  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 
400 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0584957  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  32.09 
 
 
399 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>