More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1294 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  786    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  55.67 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  55.19 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 434 aa  262  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 424 aa  252  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 407 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  39.5 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  37.63 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  39.85 
 
 		 409 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  37.63 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  37.63 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  37.63 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  37.63 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 421 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  39.24 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  37.37 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  38.96 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 422 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 437 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  37.2 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 414 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 417 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  36.78 
 
 		 418 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2913  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 427 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 448 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 		 429 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  35.42 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  39.28 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  37.87 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2214  multidrug resistance protein, putative  40.26 
 
 		 409 aa  226  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 402 aa  226  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  37.87 
 
 		 417 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 407 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  37.6 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  37.6 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  37.6 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  39.15 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 441 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 441 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2957  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2814  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.807872  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2832  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 432 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 422 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1544  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  34.65 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  33.51 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1622  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  36.25 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1697  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  38.4 
 
 		 433 aa  210  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1917  multidrug resistance protein, putative  35.92 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 397 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1731  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 422 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1692  Xaa-His dipeptidase  36.39 
 
 		 436 aa  209  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 499 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 384 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 431 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  36.22 
 
 		 526 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 481 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 409 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 537 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>