More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3894 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  100 
 
 
445 aa  853    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  89.59 
 
 
413 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  84.93 
 
 
434 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  87.53 
 
 
441 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  85.13 
 
 
417 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  87.53 
 
 
441 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  57.92 
 
 
426 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  55.11 
 
 
499 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  61.25 
 
 
440 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  56.73 
 
 
412 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  52.22 
 
 
426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  48.11 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  52.02 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  46.91 
 
 
425 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  53.89 
 
 
406 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  47.02 
 
 
422 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  52.89 
 
 
526 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  47.4 
 
 
414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  53.95 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  53.65 
 
 
537 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  47.04 
 
 
414 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  53.39 
 
 
428 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  53.26 
 
 
429 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  53.26 
 
 
429 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  53.26 
 
 
429 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  53.26 
 
 
429 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  53.26 
 
 
481 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  46.51 
 
 
414 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  44.36 
 
 
417 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 
417 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  44.36 
 
 
417 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  44.36 
 
 
417 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  44.58 
 
 
417 aa  317  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  44.36 
 
 
417 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  44.36 
 
 
417 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  44.36 
 
 
417 aa  316  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  46.24 
 
 
421 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  43.61 
 
 
424 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  50.73 
 
 
428 aa  309  8e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0084  major facilitator transporter  53.68 
 
 
423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  48.97 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  46 
 
 
417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 
422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 
424 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  48.51 
 
 
422 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  49.2 
 
 
440 aa  300  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  43.93 
 
 
438 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 
438 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  46.92 
 
 
404 aa  300  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
407 aa  299  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  47.18 
 
 
407 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  46.92 
 
 
404 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  51.79 
 
 
429 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2302  major facilitator transporter  47.29 
 
 
448 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.44154  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  44.9 
 
 
417 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  44.42 
 
 
417 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  50.62 
 
 
448 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  43.96 
 
 
438 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  44.66 
 
 
417 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  44.66 
 
 
417 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  43.85 
 
 
438 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  44.66 
 
 
417 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 
410 aa  289  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  44.14 
 
 
425 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 
410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 
393 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 
422 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 
434 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  46.26 
 
 
404 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  44.9 
 
 
405 aa  276  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  41.77 
 
 
422 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  41.36 
 
 
432 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  43.96 
 
 
416 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  48.1 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0657  major facilitator transporter  51.32 
 
 
399 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45180  Major facilitator family transporter  47.55 
 
 
457 aa  269  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  49.33 
 
 
402 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  45.76 
 
 
438 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 
428 aa  246  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2970  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
408 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4723  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 
413 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0900603  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  39.14 
 
 
405 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2978  major facilitator transporter  47.67 
 
 
390 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  41.62 
 
 
419 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  38.11 
 
 
400 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03550  arabinose efflux permease family protein  40.05 
 
 
376 aa  212  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  35.97 
 
 
393 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
434 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  34.14 
 
 
402 aa  196  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  34.72 
 
 
400 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  32.65 
 
 
410 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  32.56 
 
 
445 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4186  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
408 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513939  normal  0.0375994 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  32.65 
 
 
410 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  32.39 
 
 
410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  34.5 
 
 
407 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2213  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 
428 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175074  decreased coverage  0.00000120086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1490  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 
400 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0584957  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  33.51 
 
 
399 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22270  arabinose efflux permease family protein  39.89 
 
 
410 aa  183  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00681057  normal  0.389193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>