More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 405 aa  761    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  47.27 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 407 aa  249  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 410 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 		 410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 416 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  37.33 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  37.33 
 
 		 417 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  37.33 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  37.33 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  37.33 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  37.33 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 421 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  37.94 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  40.64 
 
 		 405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  34.93 
 
 		 424 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  36.19 
 
 		 418 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  38.04 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 441 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 441 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 414 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 438 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  34.95 
 
 		 438 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  34.95 
 
 		 438 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  34.41 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  36.91 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  36.91 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  36.91 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  36.91 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  36.91 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2970  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588323  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 414 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  35.03 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 		 440 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2213  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 428 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175074  decreased coverage  0.00000120086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 440 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 425 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0657  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03550  arabinose efflux permease family protein  41 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1490  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2302  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 448 aa  189  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.44154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  37.1 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  37.63 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4723  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0900603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  38.75 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22270  arabinose efflux permease family protein  39.25 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00681057  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 406 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  39.78 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  40 
 
 		 481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  40 
 
 		 537 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  29.57 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4186  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513939  normal  0.0375994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2978  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  30.83 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0113  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.177491  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0084  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  30.46 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02570  arabinose efflux permease family protein  36.05 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>