More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3069 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  100 
 
 		 428 aa  819    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  86.24 
 
 		 429 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  83.61 
 
 		 448 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  51.44 
 
 		 414 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  51.44 
 
 		 414 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  49.76 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  51.44 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  58.54 
 
 		 526 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  59.3 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  57.52 
 
 		 537 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  56.15 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  59.3 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  59.3 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  53.35 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  55.61 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  57.11 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  59.3 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  59.3 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0084  major facilitator transporter  59.23 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  49.29 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  48.24 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 404 aa  358  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  53.42 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 		 407 aa  352  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 422 aa  352  7e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  49.22 
 
 		 407 aa  352  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  46.84 
 
 		 417 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  46.84 
 
 		 417 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 417 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  55.47 
 
 		 402 aa  352  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  46.84 
 
 		 417 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  46.84 
 
 		 417 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  46.84 
 
 		 417 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  46.84 
 
 		 417 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2302  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 448 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.44154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  53.27 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  46.58 
 
 		 417 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  49.06 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  49.06 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 421 aa  345  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  56.51 
 
 		 440 aa  345  7e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  47.76 
 
 		 422 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  50.14 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  48.29 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  51.57 
 
 		 434 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  51.82 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  46.17 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  52.34 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  52.08 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  52.08 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  53.24 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  50 
 
 		 416 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  46.33 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  46.33 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  46.33 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  52.54 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  51.35 
 
 		 440 aa  319  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  46.08 
 
 		 417 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  45.57 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 425 aa  312  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  52.45 
 
 		 445 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  44.83 
 
 		 393 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  45.3 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 432 aa  302  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  52.01 
 
 		 402 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0657  major facilitator transporter  54.96 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  45.84 
 
 		 404 aa  289  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45180  Major facilitator family transporter  48.87 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  46.03 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  46.85 
 
 		 438 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2978  major facilitator transporter  52.6 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4723  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 413 aa  249  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0900603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2970  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4186  major facilitator superfamily MFS_1  38.57 
 
 		 408 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513939  normal  0.0375994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22270  arabinose efflux permease family protein  41.43 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00681057  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  37.63 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  39.03 
 
 		 434 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2213  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175074  decreased coverage  0.00000120086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03550  arabinose efflux permease family protein  39.25 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 407 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0420  putative permease  31.15 
 
 		 410 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.682839  hitchhiker  0.00108676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  31.15 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  31.15 
 
 		 410 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  31.48 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1490  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 384 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>