More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2851 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 409 aa  820    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  58.27 
 
 		 402 aa  461  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  56.11 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  50 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02138  hypothetical protein  53.72 
 
 		 403 aa  355  6.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003683  permease  52.01 
 
 		 407 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  42.01 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 409 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1697  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1622  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1917  multidrug resistance protein, putative  33.68 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2957  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2832  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2814  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.807872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2913  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1692  Xaa-His dipeptidase  32.98 
 
 		 436 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 393 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1544  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  33.69 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1731  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  32.97 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 422 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 417 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  31.34 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  32.97 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  31.06 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  31.06 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 426 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 438 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  31.27 
 
 		 438 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 424 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  31.61 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 414 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 445 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 417 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 422 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  30.52 
 
 		 424 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  31.1 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  31.1 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  31.1 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  31.37 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  30.83 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  30.83 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 422 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2214  multidrug resistance protein, putative  32.58 
 
 		 409 aa  169  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0657  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 438 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  29.85 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 440 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 384 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 409 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 407 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0084  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  31.39 
 
 		 526 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2302  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.44154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>