More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2064 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 409 aa  790    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  70.03 
 
 		 406 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 399 aa  312  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  42.74 
 
 		 416 aa  270  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 401 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 408 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 428 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  29.17 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.98 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.58 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  28.19 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.19 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.19 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.66 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 577 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.66 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.84 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  34.57 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  28.29 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.55 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  34.76 
 
 		 515 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.6 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  24.79 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.12 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  22.85 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.91 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.49 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.61 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.09 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.74 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  27.91 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.4 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.51 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.54 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 569 aa  70.1  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3322  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.22 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  24.65 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  24.36 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.65 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.36 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  23.58 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  27.33 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  27.33 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  27.33 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.37 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  23.67 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.78 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.54 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.53 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0856329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.44 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.24 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.2 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_003296  RS05323  transporter transmembrane protein  29.12 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  29.67 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.68 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4605  major facilitator family transporter  26.88 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.657733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  24.93 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>