More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5883 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  766    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  97.24 
 
 		 398 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  766    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  71.64 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3147  major facilitator family transporter  50.88 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2900  major facilitator family transporter  50.88 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0116  major facilitator family transporter  50.88 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1472  major facilitator family transporter  50.88 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0529  major facilitator transporter  50.88 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0694  major facilitator family transporter  50.89 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0512  major facilitator transporter  50.63 
 
 		 452 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  50.42 
 
 		 397 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  34.9 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  37 
 
 		 384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 384 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2342  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 400 aa  135  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 397 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2913  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 427 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  26.99 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 403 aa  125  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  28.38 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  28.23 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  28.38 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  28.11 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4365  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  28.01 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0357  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  30.79 
 
 		 526 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  30.38 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4723  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 413 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0900603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  30.1 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  30.51 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  30.51 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  30.51 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  30.51 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  30.51 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  30.51 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  26.8 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 422 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  30.51 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 425 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 426 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03550  arabinose efflux permease family protein  32.11 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 441 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 441 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 499 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0084  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  28.06 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  27.98 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  28.11 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  28.11 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  28.11 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>