More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4758 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  795    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 428 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  36.67 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 		 408 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  34.76 
 
 		 416 aa  169  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 406 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 409 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 401 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  32.69 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10152  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04900)  31.68 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.38 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.04 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  35.53 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  29.25 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  28.46 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  27.39 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  27.5 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 474 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  27.5 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08610  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.03 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.67 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  27.87 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  28.64 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1819  putative transporter  32.31 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  29.54 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  30 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  24.45 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  23.37 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1641  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.44 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  26.67 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  20.07 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  28.87 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.65 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.65 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  22.94 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.06 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.72 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.17 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.65 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.92 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  28.43 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05198  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07320)  27.22 
 
 		 550 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10321  conserved hypothetical protein  31.32 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.484353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.79 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3011  Arabinose efflux permease-like protein  31.67 
 
 		 561 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.48 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  28.63 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  29.17 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  21.89 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  30.56 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0890  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.18 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  25 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.83 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.83 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>