More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0185 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  94.9 
 
 
412 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  94.9 
 
 
412 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  94.66 
 
 
412 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  91.95 
 
 
410 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  91.22 
 
 
410 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  90.27 
 
 
411 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.209632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  67.02 
 
 
419 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  65.74 
 
 
403 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  68.78 
 
 
405 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4753  major facilitator superfamily MFS_1  73.42 
 
 
407 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  67.55 
 
 
420 aa  351  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  55.53 
 
 
403 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2534  major facilitator superfamily transporter  65.34 
 
 
417 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  48.27 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  47.44 
 
 
415 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  46.98 
 
 
406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  46.98 
 
 
406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1580  major facilitator superfamily MFS_1  59.52 
 
 
425 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  46.84 
 
 
399 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  48.01 
 
 
429 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 
399 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  48.23 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  48.23 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  47.06 
 
 
400 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  48.23 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  48.23 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  48.23 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  48.01 
 
 
429 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  43.48 
 
 
395 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 
389 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  46.99 
 
 
405 aa  256  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  49.32 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 
394 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 
396 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  37.73 
 
 
394 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  45.58 
 
 
389 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  46.56 
 
 
415 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  43.86 
 
 
403 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  48.32 
 
 
403 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  48.57 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  48.79 
 
 
399 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 
394 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.11 
 
 
383 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  46.36 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  49.32 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  49.05 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  49.05 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  47.25 
 
 
396 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  49.05 
 
 
399 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  38.36 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  44.48 
 
 
408 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  38.33 
 
 
389 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  38.33 
 
 
389 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 
447 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  42.2 
 
 
401 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  42.74 
 
 
391 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  46.77 
 
 
398 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
403 aa  224  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  45.53 
 
 
389 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 
407 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  42.15 
 
 
400 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.26 
 
 
399 aa  219  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  42.15 
 
 
400 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  42.15 
 
 
400 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.26 
 
 
399 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.26 
 
 
399 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  40.05 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  40.27 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  41.1 
 
 
400 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.74 
 
 
405 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.49 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.49 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.17 
 
 
403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  39.48 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  40.39 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  37.28 
 
 
407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  34.46 
 
 
415 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 
399 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  39.13 
 
 
407 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.95 
 
 
394 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
413 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  40.54 
 
 
395 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  39.34 
 
 
396 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.95 
 
 
394 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
389 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0698654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.95 
 
 
394 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.95 
 
 
394 aa  206  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.95 
 
 
394 aa  206  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  38.96 
 
 
398 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.39 
 
 
394 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.11 
 
 
399 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  38.62 
 
 
404 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  41.44 
 
 
406 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  40 
 
 
411 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  37.43 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  37.43 
 
 
399 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 
402 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>