More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2270 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 390 aa  771    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  35.46 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6453  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 410 aa  89.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  23.24 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  20.32 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.82 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  24.65 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.08 
 
 		 511 aa  72.8  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  24.65 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.87 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  30.08 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  24.65 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  24.65 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  24.65 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  24.65 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.61 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.78 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.99 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.99 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.99 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.99 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.99 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5105  multidrug resistance protein D  24.53 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.336287 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.99 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.91 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4245  multidrug resistance protein D  24.57 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0030  multidrug/H+ antiporter, major facilitator superfamily (MFS)  24.57 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.18 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4039  multidrug resistance protein D  24.57 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.679822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.37 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03557  multidrug efflux system protein  24.57 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0027  multidrug resistance protein D  24.57 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3886  multidrug resistance protein D  24.57 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03500  hypothetical protein  24.57 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4181  multidrug resistance protein D  24.57 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.47 
 
 		 609 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.64 
 
 		 590 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  21.15 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0023  multidrug resistance protein D  28.5 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  22.36 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.6 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4008  multidrug resistance protein D  28.19 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  20.69 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  21.41 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2581  membrane transport protein  28.57 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324578  normal  0.102072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.15 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  22.33 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4024  multidrug resistance protein D  28.19 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.15 
 
 		 511 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 428 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.4 
 
 		 513 aa  67  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 525 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  22.46 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.3 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  25.35 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  25.35 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  22.33 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  25.35 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.15 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4079  multidrug resistance protein D  28.19 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4129  multidrug resistance protein D  28.19 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.771712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 471 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.15 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  27.98 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.41 
 
 		 504 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  21.8 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 500 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  21.1 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>