More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1830 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  775    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  90.2 
 
 		 403 aa  686    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  65.8 
 
 		 398 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  63.59 
 
 		 408 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  63.61 
 
 		 402 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  59.19 
 
 		 409 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  62.5 
 
 		 408 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  28.49 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  28.42 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  23.86 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.36 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.27 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.27 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  23.04 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  26.83 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  27.16 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  26.15 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.25 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  20.36 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  25 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 525 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  25.42 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  25.42 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  28.99 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.86 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3490  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.95 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  32.41 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08610  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  27.98 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  21.69 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.52 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  29.71 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  22.57 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  30.82 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  23.63 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  23.66 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  22.7 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  30.39 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0360  putative permease  23.66 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>