More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2819 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  90.02 
 
 		 409 aa  701    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  78.61 
 
 		 408 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  70.07 
 
 		 398 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  66 
 
 		 402 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  63.28 
 
 		 403 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  60.98 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 428 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 393 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  31.77 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  30.89 
 
 		 409 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  30 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  23.37 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  26.05 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  26.9 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  25.96 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  23.37 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  23.06 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  25.96 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  28.35 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  21.83 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.05 
 
 		 592 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  22.35 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23780  arabinose efflux permease family protein  30.43 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  28.49 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  27 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  24.16 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  27 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0384  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  23.88 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  23.88 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  27.04 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.64 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  25.53 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  25.53 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0795  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  28.98 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  27.04 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  28.98 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.1 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  28.98 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  28.98 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  21.65 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  26.3 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  24.87 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  25.13 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  30.88 
 
 		 502 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>