More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3614 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  43.35 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  39.43 
 
 		 409 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 398 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  28.5 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  25.65 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  23.77 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  22.64 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  25.21 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  25.23 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  24.73 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4220  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  22.83 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.37 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2928  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  26.27 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 491 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  22.14 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  24.3 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.8 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.98 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1102  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1960  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.74 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.93 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4004  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.56 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.27 
 
 		 514 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.57 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 505 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.66 
 
 		 516 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.19 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.42 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.72 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.75 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 522 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.63 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  32.34 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0369  putative permease  28.68 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0362  putative permease  28.68 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.86 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  31.74 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>