More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4473 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 402 aa  784    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  66.5 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  65.91 
 
 		 409 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  65.26 
 
 		 408 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  66 
 
 		 408 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  64.84 
 
 		 403 aa  484  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  63.61 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  39 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 393 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  32.18 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  29.25 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  26.14 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  31 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  31.35 
 
 		 502 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  23.35 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  23.75 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.28 
 
 		 525 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  24.39 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  24.39 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  24.39 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  24.39 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  22.44 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29400  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  24.04 
 
 		 549 aa  76.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  22 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  28.11 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.78 
 
 		 532 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  23.36 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.06 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  33 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  35.95 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2186  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  23.36 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 525 aa  73.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  28.61 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 474 aa  72.8  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.47 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  27.66 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  27.98 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1871  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00512651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  27.98 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  27.98 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1983  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  27.98 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  30.56 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  21.88 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  28.82 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.32 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.65 
 
 		 530 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  23.71 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  30 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 534 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  28.44 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.27 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  23.4 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  28.44 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>