More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2186 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2186  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 396 aa  739    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  53.03 
 
 		 406 aa  345  8.999999999999999e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  51.8 
 
 		 407 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  57.1 
 
 		 406 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  55.1 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  52.83 
 
 		 393 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  48.42 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  51.53 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  50.14 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 389 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  50 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  49.86 
 
 		 390 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  49.34 
 
 		 389 aa  282  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  49.71 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  49.71 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  49.71 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  49.71 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  49.71 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  48.21 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 388 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  49.71 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  47.67 
 
 		 391 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  48.2 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  47.67 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  48.15 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  47.4 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  47.4 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  45.95 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  43.9 
 
 		 430 aa  269  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  49.33 
 
 		 388 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 409 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  46.84 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  44.7 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  44.7 
 
 		 395 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  46.74 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  47.18 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 384 aa  255  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  47.13 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 408 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.7 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  39.64 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  43.13 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  38.06 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  43.13 
 
 		 391 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  42.86 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 389 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  42.86 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  47.54 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  39.59 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  39.59 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  39.59 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  42.86 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  39.59 
 
 		 404 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  39.64 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 415 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  39.13 
 
 		 404 aa  242  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  43.27 
 
 		 403 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  39.13 
 
 		 415 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  39.13 
 
 		 404 aa  242  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  45.77 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  46.11 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>