More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4478 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  748    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  27.17 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  28.46 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  26.74 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  28 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  28.41 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  25.14 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  25.43 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  34.27 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  24.44 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  24.93 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 		 402 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 449 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4100  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.7 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.41549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  28.99 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  27.2 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  25.37 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  25.37 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  25.88 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.2 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08030  arabinose efflux permease family protein  26.61 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.566013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6215  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  27.61 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  28.93 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  25 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  25.36 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  27.23 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1348  arabinose efflux permease  24.44 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0715454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 503 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  24.46 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  30.17 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 450 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  26.65 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  23.21 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10862  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06760)  28.02 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  26.35 
 
 		 418 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 538 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  26.72 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 434 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 		 478 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29400  A(acid, azole) Q(quinidine) Resistance  27.13 
 
 		 549 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 449 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4363  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  25.93 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 450 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4540  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.65 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>