More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08030 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08030  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 388 aa  761    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.566013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  38.6 
 
 		 399 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  39.79 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5596  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2287  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3237  transporter of the MFS superfamily  34.22 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1178  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0192681  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0795  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20900  putative MFS transporter  40.24 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  32.49 
 
 		 425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 392 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  31.1 
 
 		 403 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  26.82 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  27.34 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  27.3 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  27.3 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  26.82 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  27.3 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  26.82 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  27.3 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  30.77 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 390 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  27.3 
 
 		 404 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 408 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 405 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  26.82 
 
 		 391 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 408 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  30.15 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 391 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  25.71 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  26.02 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  29.92 
 
 		 416 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 415 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 391 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 391 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 419 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  32.11 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 394 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  30.56 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 400 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 409 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  25.97 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 391 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 391 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  31.05 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  27.63 
 
 		 423 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  30.69 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 383 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  28.57 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  28.57 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  28.57 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  28.81 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>