More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1231 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
401 aa  799    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  38.34 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  35.18 
 
 
398 aa  247  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  35.98 
 
 
403 aa  233  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 
397 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
397 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  33.86 
 
 
409 aa  219  5e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  35.73 
 
 
410 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  30.69 
 
 
411 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  31.91 
 
 
406 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  31.95 
 
 
407 aa  216  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
397 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  31.79 
 
 
404 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  33.98 
 
 
411 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  33.16 
 
 
408 aa  209  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  32.9 
 
 
408 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 
408 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  32.9 
 
 
408 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  32.9 
 
 
408 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  32.9 
 
 
408 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  34.46 
 
 
404 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  33.93 
 
 
410 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  32.81 
 
 
409 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
399 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
403 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  32.56 
 
 
403 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
403 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
406 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
403 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
400 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  30.75 
 
 
405 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  27.66 
 
 
416 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  35.23 
 
 
404 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  35.23 
 
 
404 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  35.23 
 
 
404 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  35.23 
 
 
404 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  35.23 
 
 
404 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  34.72 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  34.97 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  34.72 
 
 
404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
413 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  34.03 
 
 
404 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  30.05 
 
 
431 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  32.2 
 
 
404 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  32.2 
 
 
404 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  32.2 
 
 
404 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  32.2 
 
 
404 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  32.2 
 
 
404 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  28.95 
 
 
420 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  28.72 
 
 
487 aa  169  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.83 
 
 
416 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  26.56 
 
 
406 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  28.12 
 
 
418 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  32.45 
 
 
389 aa  158  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 
407 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
410 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
406 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  27.35 
 
 
394 aa  146  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  27.08 
 
 
394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  29.35 
 
 
411 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  27.07 
 
 
412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  26.97 
 
 
415 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  27.38 
 
 
407 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
404 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  35.48 
 
 
418 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  35.48 
 
 
418 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  26.27 
 
 
450 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  26.75 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  25.4 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
428 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  24.78 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  24.61 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  29.95 
 
 
424 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  28.99 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.89 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  27.78 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  31.16 
 
 
414 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  25.15 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  29.19 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  24.12 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  27.55 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  28.71 
 
 
423 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  28.71 
 
 
423 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  27.04 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  28.23 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.93 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  27.81 
 
 
396 aa  64.3  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>