More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6507 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 393 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  89.46 
 
 		 402 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  72.8 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 398 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 403 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 398 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  38.68 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  33.33 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  31.39 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  24.39 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  28.65 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.83 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.17 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  22.81 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.63 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  33.33 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.47 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.24 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.63 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.11 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.88 
 
 		 521 aa  62.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  23.45 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.49 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  25 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  27.43 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2633  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  22.81 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1322  major facilitator superfamily transporter  30.15 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3946  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4409  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  32.29 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  25.47 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.47 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  25.47 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  25.47 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.47 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.47 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  25.47 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.19 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03888  multidrug efflux transporter (Eurofung)  27.04 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.42 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  26.55 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  21.88 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0749  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  27.27 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.7 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.7 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.22 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.44 
 
 		 590 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>