More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1322 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1322  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
457 aa  860    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.723677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  43.28 
 
 
470 aa  243  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 
493 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.56 
 
 
505 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.6 
 
 
522 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.98 
 
 
494 aa  149  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 
609 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 
512 aa  149  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.99 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 
511 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 
646 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 
646 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  27.36 
 
 
496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.42 
 
 
480 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 
558 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.2 
 
 
478 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 
541 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 
646 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 
504 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.8 
 
 
467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.13 
 
 
516 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.13 
 
 
514 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.97 
 
 
627 aa  136  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  31.13 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.31 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 
496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.31 
 
 
529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 
529 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.87 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.09 
 
 
490 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.18 
 
 
521 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.98 
 
 
517 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.57 
 
 
514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 
539 aa  130  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.49 
 
 
534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.43 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  28.53 
 
 
452 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.03 
 
 
475 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4220  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 
510 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 
537 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.28 
 
 
515 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.35 
 
 
466 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 
458 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 
504 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.56 
 
 
520 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 
521 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 
532 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.62 
 
 
478 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 
445 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 
463 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 
538 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 
478 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.08 
 
 
515 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  28.23 
 
 
488 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  27.68 
 
 
479 aa  123  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.15 
 
 
514 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 
484 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 
478 aa  122  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 
483 aa  123  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 
502 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.83 
 
 
540 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 
543 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.57 
 
 
542 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  25.71 
 
 
490 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.38 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  26.4 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.44 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  25.81 
 
 
464 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.28 
 
 
513 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 
545 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 
501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  30.16 
 
 
476 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  28.82 
 
 
523 aa  119  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.44 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.81 
 
 
492 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.49 
 
 
510 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.39 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.78 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_02600  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.87 
 
 
505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.61 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
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NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 
529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3127  major facilitator family transporter  24.7 
 
 
463 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000190248  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  25.85 
 
 
492 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.33 
 
 
492 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  27.55 
 
 
579 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1157  major facilitator family transporter  24.1 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 
471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 
489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.387969 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.66 
 
 
570 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 
507 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.503144  normal  0.675575 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
455 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.12 
 
 
492 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  27.82 
 
 
475 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
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NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  25.95 
 
 
465 aa  117  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
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