More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1015 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  100 
 
 		 523 aa  1035    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1304  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.3 
 
 		 485 aa  312  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.51 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0907  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.05 
 
 		 497 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1365  putative multidrug resistance-like efflux transmembrane protein  38.37 
 
 		 487 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5562  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 502 aa  292  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.449496  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_1393  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.4 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230951  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 		 463 aa  279  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.49 
 
 		 543 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1941  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 		 493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.03 
 
 		 531 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.34 
 
 		 482 aa  270  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4538  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 498 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.85 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.53 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 515 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 520 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.95 
 
 		 517 aa  193  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.94 
 
 		 517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.59 
 
 		 521 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.58 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 520 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 520 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 520 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 		 514 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
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NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
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NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 520 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 520 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 520 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  26.56 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 		 520 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.19 
 
 		 520 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
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NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 		 474 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.43 
 
 		 520 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 520 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 520 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.43 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 		 529 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.14 
 
 		 526 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.53 
 
 		 526 aa  164  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.62 
 
 		 529 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 527 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 520 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.19 
 
 		 525 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.35 
 
 		 504 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.67 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.52 
 
 		 471 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.48 
 
 		 579 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 514 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 		 493 aa  158  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.79 
 
 		 482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 		 530 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.21 
 
 		 531 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 		 501 aa  156  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  24.46 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.19 
 
 		 514 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 519 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.52 
 
 		 481 aa  153  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.52 
 
 		 481 aa  153  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.14 
 
 		 524 aa  153  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.75 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.79 
 
 		 530 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 529 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 		 524 aa  150  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.79 
 
 		 530 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.79 
 
 		 530 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.55 
 
 		 523 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.22 
 
 		 510 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.22 
 
 		 503 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.03 
 
 		 658 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 		 539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.52 
 
 		 541 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.34 
 
 		 521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1875  multidrug resistance protein B  31.33 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2586  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.38 
 
 		 468 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941296  hitchhiker  0.00272882 
 
 
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NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.7 
 
 		 511 aa  148  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009513  Lreu_0947  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000410718  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.14 
 
 		 534 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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