More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1238 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1365  putative multidrug resistance-like efflux transmembrane protein  87.6 
 
 		 487 aa  777    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816308  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_1238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 485 aa  941    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1304  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  98.35 
 
 		 485 aa  926    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1393  EmrB/QacA family drug resistance transporter  70.85 
 
 		 508 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230951  normal  0.648056 
 
 
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NC_007347  Reut_A1941  EmrB/QacA family drug resistance transporter  68.28 
 
 		 493 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172476  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_0907  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.63 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_0437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.53 
 
 		 497 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
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NC_007950  Bpro_5562  major facilitator transporter  53.5 
 
 		 502 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.449496  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_4538  major facilitator transporter  53.78 
 
 		 498 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.03 
 
 		 482 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383869  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.58 
 
 		 543 aa  361  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.02 
 
 		 539 aa  310  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.53 
 
 		 537 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.91 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.18 
 
 		 531 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.66 
 
 		 517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 493 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.92 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.58 
 
 		 513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 510 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 539 aa  183  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 515 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 515 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 521 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 		 517 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 		 515 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 479 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 479 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 530 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.12 
 
 		 516 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.81 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  29.53 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.99 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  28.17 
 
 		 496 aa  177  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.27 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 545 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 		 529 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.27 
 
 		 529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.55 
 
 		 537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.61 
 
 		 561 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.4 
 
 		 579 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 517 aa  174  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 511 aa  174  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 511 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 		 564 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 511 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.38 
 
 		 520 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
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NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
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NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 		 523 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.77 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
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NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 521 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 		 519 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.28 
 
 		 511 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.58 
 
 		 482 aa  170  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.36 
 
 		 513 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 534 aa  169  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 519 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 519 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 519 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.78 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.32 
 
 		 519 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.75 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.54 
 
 		 570 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.68 
 
 		 492 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.14 
 
 		 492 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0985  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 		 501 aa  166  5.9999999999999996e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000298388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  25.68 
 
 		 492 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 484 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.04 
 
 		 496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  29.61 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 		 527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.57 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.57 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 		 523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
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NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.88 
 
 		 635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 		 526 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 537 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  25.68 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 519 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 		 540 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
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NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.76 
 
 		 512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
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